Coursera · סדרה של 4 קורסים

קורס אונליין – תעודה מקצועית מוסמכת בשיטות ביואינפורמטיקה של צמחים של אוניברסיטת טורונטו

עבור 15 השנים האחרונות, חלו שינויים מרגשים בתחום ביולוגיית הצמחים. מאות גנומים של צמחים רצו ונסרקו, טכנולוגיית RNA-seq אפשרה פרופילינג של ביטוי גנטי ברמה רחבה, והתפשטות של שיטות מבוססות "-seq" אפשרה לקבוע אינטראקציות בין חלבונים ובין חלבונים ל-DNA במחירים נגישים ובכמויות גדולות. מערכות הנתונים הללו מאפשרות לנו ליצור השערות בלחיצת עכבר או נגיעה במסך.

מתחיליםרמת קושי
סדרה של 4 קורסיםתעודה
להרשמה בקורסרה ← הקורס הראשון חינם · audit · ללא כרטיס אשראי
קורס אונליין – תעודה מקצועית מוסמכת בשיטות ביואינפורמטיקה של צמחים של אוניברסיטת טורונטו
למד מיומנויות מבוקשות ממומחים אוניברסיטאיים ותעשייתיים שלוט בנושא או בכלי דרך פרויקטים מעשיים פיתח הבנה מעמיקה של מושגים מרכזיים קבל תעודת הסמכה לקריירה מאוניברסיטת טורונטו
רמה מתחילים
מסגרת סדרה של 4 קורסים

למי הקורס מתאים

1
למד מיומנויות מבוקשות ממומחים אוניברסיטאיים ותעשייתיים
2
שלוט בנושא או בכלי דרך פרויקטים מעשיים
3
פיתח הבנה מעמיקה של מושגים מרכזיים
4
קבל תעודת הסמכה לקריירה מאוניברסיטת טורונטו

מה תלמדו

אנליזת גנטיקה

אנליזת ביואינפורמטיקה

אבולוציה

גנומיקה השוואתית

מיומנויות שתרכשו

טכניקות למידה חשיבה אנליטית פתרון בעיות מיומנויות תקשורת עבודת צוות ניהול זמן כישורי הצגה חשיבה יצירתית מחשבות אסטרטגיות מיומנויות מחקר
§ סקירת הקורס
01

תיאור הקורס

התמחות - סדרת ארבעה קורסים

עבור 15 השנים האחרונות, חלו שינויים מרגשים בתחום ביולוגיית הצמחים. מאות גנומים של צמחים רצו ונסרקו, טכנולוגיית RNA-seq אפשרה פרופילינג של ביטוי גנטי ברמה רחבה, והתפשטות של שיטות מבוססות "-seq" אפשרה לקבוע אינטראקציות בין חלבונים ובין חלבונים ל-DNA במחירים נגישים ובכמויות גדולות. מערכות הנתונים הללו מאפשרות לנו ליצור השערות בלחיצת עכבר או נגיעה במסך.

תוכן הקורס

  • מיומנויות וכלים בסיסיים בתחום הביואינפורמטיקה:
    • Genbank של NCBI
    • Blast
    • יישורי רצפים מרובים
    • פילוגנטיקה בשיטות ביואינפורמטיקה I
  • אינטראקציות חלבון-חלבון
  • ביואינפורמטיקה מבנית
  • ניתוח RNA-seq בשיטות ביואינפורמטיקה II
  • 33 כלים מקוונים ייחודיים לצמחים:
    • דפדפני גנום
    • כריית נתוני רנ"א
    • ניתוחי פרומוטרים ורשתות
  • קורס גמר בביואינפורמטיקה של צמחים:
    • העלאת השערה על תפקיד ביולוגי של גן הפונקציה שלו אינה ידועה
    • סיכום בדו"ח מעבדה כתוב

מטרת ההתמחות

התמחות זו שימושית לכל ביולוג מולקולרי מודרני בתחום הצמחים שמעוניין להיחשף לנתונים המרשימים הזמינים לחוקרים. במהלך השיעורים ישנה הכנסת מעט תכנות R בשיטות ביואינפורמטיקה II, אך רוב הכלים הם יישומים מקוונים.

דרישות טכניות
  • מומלץ להיות בעל גישה למחשב נייד או שולחני.
  • כלים עשויים שלא funcionar כה aplicações ניידות על טלפון או טאבלט.

פרויקט למידה יישומית

התמחות ביואינפורמטיקה של צמחים בקורסרה מציגה מיומנויות וכלים בסיסיים בביואינפורמטיקה, כמו Genbank של NCBI, Blast, יישורי רצפים מרובים, ופילוגנטיקה בשיטות ביואינפורמטיקה I, ולאחר מכן אינטראקציות חלבון-חלבון, ביואינפורמטיקה מבנית וניתוח RNA-seq בשיטות ביואינפורמטיקה II. בקורס בביואינפורמטיקה של צמחים אנו כוללים 33 כלים מקוונים ייחודיים לצמחים, מדפדפני גנום ועד כריית נתוני רנ"א, ניתוחי פרומוטרים ורשתות ועוד. לבסוף, קורס גמר בביואינפורמטיקה של צמחים משתמש בכלים הללו כדי להעלות השערה על תפקיד ביולוגי של גן הפונקציה שלו אינה ידועה, עם סיכום בדו"ח מעבדה כתוב.

§ תוכן עניינים
02

מבנה הקורס

שיטות ביו-אינפורמטיקה I

קורס 1 • 19 שעות • 4.7 (1,721 דירוגים)

פרטי הקורס

מה תלמדו

  • פרויקטים בולטים בביולוגיה כגון ריצוף הגנום האנושי וסקרים של ביטוי גנים באמצעות RNA-seq, מיקרו-מערכים וטכנולוגיות נוספות יצרו שפע של נתונים לביולוגים.
  • האתגר העומד בפני המדענים הוא ניתוח ואפילו גישה לנתונים הללו כדי להפיק מידע שימושי הקשור למערכת הנחקרת.
  • הקורס מתמקד בשימוש במשאבים ביו-אינפורמטיים קיימים – בעיקר תוכניות ואתרים באינטרנט – כדי לגשת לשפע הנתונים ולענות על שאלות רלוונטיות לביולוג הממוצע.
  • הנושאים נכללים: יישור רצפים מרובים, פילוגנטיקה, ניתוח נתוני ביטוי גנים ורשתות אינטראקציה חלבונית.
החלק הראשון
  • שיטות ביו-אינפורמטיקה I (זה) עוסק בבסיסים נתונים, Blast, יישור רצפים מרובים, פילוגנטיקה, ניתוח בחירה ומטגן-גנומיקה.
החלק השני
  • שיטות ביו-אינפורמטיקה II עוסק בחיפוש מוטיבים, אינטראקציות חלבון-חלבון, ביו-אינפורמטיקה מבנית, ניתוח נתוני ביטוי גנים וחיזוי רכיבי cis.

מיומנויות שתשיגו

  • קטגוריה: ניתוח גנטי
  • קטגוריה: ניתוח ביו-אינפורמטי
  • קטגוריה: אבולוציה
  • קטגוריה: גנומיקה השוואתית

שיטות ביו-אינפורמטיקה II

קורס 2 • 18 שעות • 4.7 (478 דירוגים)

פרטי הקורס

מה תלמדו

  • פרויקטים בולטים בביולוגיה כגון ריצוף הגנום האנושי וסקרים של ביטוי גנים באמצעות RNA-seq, מיקרו-מערכים וטכנולוגיות נוספות יצרו שפע של נתונים לביולוגים.
  • האתגר העומד בפני המדענים הוא ניתוח ואפילו גישה לנתונים הללו כדי להפיק מידע שימושי הקשור למערכת הנחקרת.
  • הקורס מתמקד בשימוש במשאבים ביו-אינפורמטיים קיימים – בעיקר תוכניות ואתרים באינטרנט – כדי לגשת לשפע הנתונים ולענות על שאלות רלוונטיות לביולוג הממוצע.
החלק הראשון
  • שיטות ביו-אינפורמטיקה I עסק בבסיסים נתונים, Blast, יישור רצפים מרובים, פילוגנטיקה, ניתוח בחירה ומטגן-גנומיקה.
זה, החלק השני
  • שיטות ביו-אינפורמטיקה II יעסוק בחיפוש מוטיבים, אינטראקציות חלבון-חלבון, ביו-אינפורמטיקה מבנית, ניתוח נתוני ביטוי גנים וחיזוי רכיבי cis.

מיומנויות שתשיגו

  • שימוש בכלים ביו-אינפורמטיים רבים.

ביו-אינפורמטיקה צמחית

קורס 3 • 13 שעות • 4.8 (240 דירוגים)

פרטי הקורס

מה תלמדו

  • 15 השנים האחרונות היו מרגשות בתחום הביולוגיה הצמחית.
  • מאות גנומים צמחיים נרצפו, RNA-seq אפשרה פרופיל ביטוי רחב.
  • הגידול בשיטות מבוססות "-seq" אפשרה לקבוע אינטראקציות חלבון-חלבון וחלבון-DNA בקלות ובכמות גבוהה.
  • נתונים אלו מאפשרים לנו ליצור השערות בלחיצת עכבר.

מבנה

  • כל אחד מששת המודולים המעשיים נמשך כשישה שבועות.
  • הקדמה באורך כ-2 דקות, הרצאה תיאורטית של כ-20 דקות, מעבדה מעשית של שעה וחצי.
  • דיון מעבדה של כ-20 דקות אם יש קשיים במעבדה, וסיכום של כ-2 דקות.

כלים המכוסים [חומרים מעודכנים ביוני 2024]

  • מודול 1: בסיסי נתונים גנומיים / עצי גנים מחושבים מראש / כלים לחלבון.
  • מודול 2: כלים לביטוי.
  • מודול 3: כלים לקו-ביטוי.
  • מודול 4: ניתוח פרומוטור.
  • מודול 5: ניתוח העשרה של GO וחזותי מסלול.
  • מודול 6: חקר רשתות.

קורס מתקדם בביו-אינפורמטיקה צמחית

קורס 4 • 9 שעות • 4.7 (27 דירוגים)

פרטי הקורס

מה תלמדו

  • 15 השנים האחרונות היו מרגשות בתחום הביולוגיה הצמחית.
  • מאות גנומים צמחיים נרצפו, RNA-seq אפשרה פרופיל ביטוי רחב.
  • בקורס זה נשתמש בכלים על מנת להניח תפקיד ביולוגי עבור גן בעל תפקוד לא ידוע.

קורס זה הוא חלק מההתמחות בביו-אינפורמטיקה צמחית

  • מציג מיומנויות ותוכנים ביו-אינפורמטיים מרכזיים.
  • פותח במימון הפקולטה לאמנויות ומדעים באוניברסיטת טורונטו.

ראיתם את הקורס. מוכנים להירשם?

מעבר לקורסרה · הקורס הראשון פתוח לצפייה חינם · ביטול בכל שלב

לפרטים נוספים והרשמה בקורסרה ←
§ עוזרים להתחיל

3 וידאוים קצרים לפני שנרשמים לקורס.

לפני שאתם מוציאים כרטיס אשראי — קחו 6 דקות. סבר על Coursera, איך נרשמים, ואיך התעודה משתלבת בלינקדאין שלכם.

צפו · 2 דק'

מה זה Coursera?

סקירה קצרה של פלטפורמת הלימוד הגדולה בעולם — מי מאחוריה, איך התעודות מוכרות, ומה ההבדל מ-Udemy ו-edX.

צפו בסרטון ←
צפו · 2 דק'

איך נרשמים ב-2 דקות

הדגמה ויזואלית של תהליך ההרשמה — מהקלקה על "להרשמה" ועד תחילת הקורס הראשון. כולל אופציית audit חינמי.

צפו בסרטון ←
צפו · 2 דק'

איך מכניסים את התעודה ל-LinkedIn

הוספת התעודה כ-License & Certification בפרופיל לינקדאין, עם קישור ל-Coursera שמעלים את הקרדיביליות.

צפו בסרטון ←

מוכנים להתחיל?

הקורס מחכה. התעודה מחכה.

הקורס זמין ב-Coursera. הקורס הראשון בסדרה פתוח לצפייה ללא תשלום.

⚠ MSL הוא קטלוג קורסים — לא ספק הקורס. הקורס מתפרסם ומנוהל דרך פלטפורמת Coursera. תוכן הקורס, עלויות, תעודות, ותנאי שימוש — באחריות Coursera והמרצים. MSL מציג את המידע מתוך מטרה לעזור לגולש לבחור, ולא מספק את הקורס עצמו.

בישראל פועלות כ-1,800 חברות בתחום מדעי-החיים (רשות החדשנות, 2024–25), ורבות מהן עוסקות באגרוטק, גנומיקה צמחית וחקלאות מדייקת — תחומים שבהם היכולת לנתח רצפי DNA ונתוני ביטוי גנטי שווה זהב. בעשור וחצי האחרונים השתנה התחום מהיסוד: מאות גנומים של צמחים רוצפו, טכנולוגיית RNA-seq אפשרה מיפוי ביטוי גנטי בקנה-מידה רחב, ושיטות מבוססות "seq" הוזילו עד מאוד את היכולת לאתר אינטראקציות בין חלבונים ובין חלבונים ל-DNA. כל אלה יוצרים מאגרי נתונים עצומים שמתוכם אפשר לגזור השערות מחקריות כמעט בלחיצת כפתור.

ההתמחות, שמסופקת על-ידי Coursera ברמת מתחילים, בנויה כסדרה של ארבעה קורסים שמובילים מהבסיס ועד פרויקט-גמר עצמאי. מתחילים בכלים הקלאסיים של התחום: GenBank של NCBI, חיפושי BLAST, יישור רצפים מרובים וניתוח פילוגנטי. משם עוברים לנושאים מתקדמים יותר — אינטראקציות חלבון-חלבון, ביואינפורמטיקה מבנית וניתוח RNA-seq, שבו נכנס גם מעט תכנות ב-R.

חלק נכבד מההתמחות מוקדש ל-33 כלים מקוונים ייחודיים לצמחים: דפדפני גנום, כלים לכריית נתוני RNA, ניתוח פרומוטרים ובניית רשתות גנטיות. רוב הכלים הם יישומים מבוססי-דפדפן, כך שאין צורך בהתקנות מורכבות — אבל כדאי לדעת שמומלץ לעבוד ממחשב נייד או שולחני, מאחר שחלק מהכלים אינם פועלים כראוי בטלפון או בטאבלט.

בקורס-הגמר מחברים את כל החתיכות יחד: בוחרים גן שתפקודו אינו ידוע, ומשתמשים בארגז-הכלים שנלמד כדי לגבש השערה על תפקידו הביולוגי — ולסכם הכול בדו"ח-מעבדה כתוב, בדיוק כמו שעושים במחקר אמיתי.

למי זה מתאים? לכל מי שעוסק בביולוגיה מולקולרית של צמחים ורוצה להפסיק לפחד מהנתונים. הכישורים הנרכשים כאן רלוונטיים למגוון תפקידים — מניתוח נתוני RNA-seq וגנום, דרך מחקר אינטראקציות חלבון-חלבון, ועד פילוגנטיקה וכריית נתונים בביולוגיה. בהקשר התעסוקתי כדאי לזכור שזו הערכה בלבד: ההשתלבות והשכר בפועל תלויים בניסיון, במעסיק ובאזור.

מקורות

  • Coursera — עמוד ההתמחות הרשמי
  • רשות החדשנות 2024-25

עזר לך העמוד?

אני לא בטוח, יש לי שאלה
תודה! קיבלנו.